Tomando lugar brevemente después de la serie de historietas Halo: Uprising, Halo 3 comienza con el Jefe Maestro cayendo a la atmósfera terrestre e impactando en una jungla africana, donde es recogido por el Inquisidor y el Sargento Johnson. El Jefe Maestro y compañía se abren paso hacia una base del UNSC, donde Miranda Keyes y Lord Hood planean un ataque aéreo hacia las naves del Profeta de la Verdad, que se han estacionado sobre un misterioso artefacto Forerunner desenterrado de las arenas de las ruinas de la ciudad de Nueva Mombasa, el "Arca". Cuando el Jefe destruye todas las fuerzas antiaéreas del Covenant en la ciudad de Voi, Hood comienza su ataque, sin embargo Verdad activa el artefacto antes de lo esperado, que se revela como un portal por el que el y sus seguidores pasan. Luego, una nave Covenant en control de los Flood llega a la Tierra y se estrella en Voi, infectándola.

Para comenzar la versión 2008 que salió para todas las consolas de la próxima generación - que se esperaba, fuera tal vez un tanto más sorprendente-, pero ésta gran implementación o apertura a todas estas consolas terminó causando una versión irregular frente a las anteriores. Lo que ha dejado a Konami un poco decepcionado, pero no hay mal que por bien no venga, ya que pondrán todas sus energías en la nueva versión del PES 2009, donde se hará un replanteamiento total.

Aunque en el PES 2008, se han agregado nuevas funcionalidades y características que lo convirtieron en un juego deseable para todos sus fans, agregando un nuevo sistema de inteligencia artificial, mejores gráficos y demás, le quedaron algunas cosas en el tintero.

Jade, habitante de Hillys, vive en un faro con su Tío Zerdy (un cerdo antropomórfico) y grupo de niños cuyos padres han desaparecido a causa de los ataques que la raza alienígena Domz realiza habitualmente en su planeta. Un día, la zona donde viven se ve atacada por los Domz, y Jade corre a ponerse a salvo. Pero cuando intenta activar los escudos, descubre con horror que se le ha acabado el dinero y la Compañía Optima le ha cortado el suministro energético. En ese momento, los Domz atacan el faro, y Jade debe luchar contra ellos para salvar a los niños. Cuando cree haberlos vencido, es arrastrada a una cueva subterránea, en la que, con la ayuda de Zerdy, se enfrenta a un terrible monstruo. Las secciones Alpha, protectoras del planeta, llegan al rescate más tarde de lo esperado, siendo su intervención un tanto inútil.